Наблюдаю аналогичное поведение. Во второй версии такого нет — папка в Корзину не попадает.
Посмотрите на форуме:
forum.farmanager.com • Главная страница что-либо на эту тему, поищите существующий тикет на мантисе:
MantisBT. Не найдёте — открывайте новый (потребуется регистрация).
