По мне так FreeBSD постабильнее Линукса, хотя несколько сложнее в настройке(точнее не сложнее, а просто дело в привычке, тк в Линуксе она более виндаподобная).
Да, вообщем большой разницы и нету (не в смысле их внутренностей, а всмысле возможностей), просто Линукс побольше раскручен
Хочу еще заметить, что Винда тоже не так уж плоха...