Kiert, причиной подобного поведения может быть активность остальных разделов ваших HDD, не принимающих участие в вашей текущей конфигурации загрузки, и остатками на них прежних версий загрузочных файлов.
MultiBoot 2.0.1.0 - отчет получите на вкладке "Дополнительно" (выберите "полный - с enum all).
если у вас 1.7.2, то на Win 7 она может сделать не вполне корректные изменения. Ищите 2.0 beta.
