[Foreigner]

К сожалению, так не получится передать несколько "файлов" одной программе (одному экземпляру) в виде цепочки параметров. »

Это уже надо разбираться конкретно, ТС поставил общую задачу. Firefox, например, открыл сразу несколько файлов, в одном экземпляре приложения.